Budynki sejmowe, znajdujące się w kwartale wyznaczonym przez ulice Wiejską, Górnośląską i Frascati oraz skarpę wiślaną, zostały uszkodzone w czasie walk we wrześniu 1939 r. Szczególnie ucierpiała sala posiedzeń, której dach zapadł się do środka. Uszkodzenia pozostałych budynków (hotelu sejmowego i dawnego Instytutu Maryjskiego) były na tyle niewielkie, że mogły być one wykorzystywane przez niemieckiego okupanta.

Sejm znalazł się w bezpośrednim sąsiedztwie tzw. dzielnicy policyjnej, której centrum stanowił gmach komendy Policji Porządkowej (Ordnungspolizei) w alei Szucha. Z całej dzielnicy, której osią były Aleje Ujazdowskie i ulica Belwederska, ludność polską wysiedlono. Obszar ten przeznaczony został na miejsce zamieszkania niemieckich urzędników, oficerów i innych pracowników aparatu okupacyjnego. Wokół tej dzielnicy rozmieszczono jednostki policyjne i wojskowe, mające stanowić jej zabezpieczenie. W budynkach sejmowych urządzono koszary kilku batalionów tzw. Policji Prewencyjnej  (Schutzpolizei), czyli specjalnych, zmilitaryzowanych oddziałów wchodzących w skład Policji Porządkowej.

Sejm